Заслушан доклад молодого ученого

5 февраля лабораторией Интегративной биологии Института Биофизики НАНА был организован онлайн-семинар на тему «Annotation of alternative proteomes derived from alternative splicking and frameshifting».

На онлайн-семинаре, который был организован на платформе «Zoom» по теме выступила младший научный сотрудник лаборатории Интегративной биологии, победительница программы двойной докторантуры организованной совместно НАНА и Университетом Монпелье Франции на 2019-2022 учебные годы Зарифа Османлы.

Она отметила, что основным направлением исследований даборатории Структурной биоинформатики и молекулярного моделирования (Институт клеточной биологии, CNRS), в которой она работает в рамках программы двойной докторантуры, является изучение структуры и функций белков с помощью биоинформатических программ на основе их аминокислотных последовательностей. Подчеркнув, что существуют два основных района белков, глобулярный и неглобулярный, она отметила, что неглобулярные  в свою очередь, делятся на нерегулярные и тандемные повторяющиеся подгруппы, которые имеют тенденцию к агрегации. Докладчик проинформировала, что в настоящее время в лаборатории создаются, совершенствуются и интегрируются биоинформатические программы для широкомасштабного анализа перечисленных районов и подгрупп, а также указала, что основным направлением ее докторской диссертации является изучение темных протеомов с использованием существующих биоинформатических программ и написанием новых программ.

По словам докладчика, многие механизмы транскрипции и посттранскрипции приводят к образованию новых белков и изоформ этих белков. Среди этих механизмов особое место занимают механизмы “Alternative splicing” и “frameshifting” (скольжения рамы). Структурно-функциональный анализ альтернативных протеомов, полученных с помощью этих механизмов, составляет основную часть работы.  Аннотация альтернативных протеомов про-мРНК является широко распространенным механизмом, который генерирует разнообразие белков в эукариотических организмах. Сравнительный анализ изоформных и референтных белковых последовательностей проводится с учетом возможности получения нескольких белков — изоформ, образующихся из одной кодирующей области. Аннотация альтернативных протеомов служит для углубленного изучения областей кодирования геномов, выявления потенциально новых белков, распознавания областей генома, которые в большей степени подвержены влиянию в процессе эволюции. Докладчик также подчеркнула, что до недавнего времени было обнаружено, что “скольжение рамы” (frameshift), который приводит только к появлению мутантных белков или преждевременному стоп-кодону, уже был способом, используемым для создания новых белков в процессе эволюции.

После заслушивания доклада генеральный директор Института Биофизики, член-корреспондент НАНА Октай Гасымов, заместитель директора по научной работе, д.б.н. Керим Гасымов, заведующий лабораторией Интегративной биологии, член-корреспондент НАНА Ильхам Шахмурадов, заведующий лабораторией Молекулярные основы интегративной деятельности Института физиологии имени академика Абдуллы Гараева, д.б.н. Ариф Мехтиев и другие выступили с вопросами и предложениями на эту тему.

05 Февраль 2021

Поделиться