Научные результаты, полученные Институтом биофизики в сотрудничестве с Монпелье университетом, были опубликованы в журнале с высоким импакт-фактором
Белки являются сложными молекулами, которые выполняют важнейшие функции в любом живом организме. Белки, являющиеся многочисленными и разнообразными молекулами, выполняющими большую часть работы в клетках, необходимы для структуры, функций и регуляции клеток, тканей и органов живых существ.
Как правило, экспериментальные исследования направлены на определение структуры и функций канонических (то есть первоначально обнаруженных и наиболее часто встречающихся) белков. Однако исследования показывают, что (по крайней мере) большинство белков имеют свои альтернативные (вариативные) изоформы. В настоящее время интерес к определению этих альтернативных форм и их структурно-функциональным исследованиям быстро растет с точки зрения кодирующего статуса геномов, функциональной активности клеток, генетических заболеваний и др. В последние годы были достигнуты значительные успехи в создании инструментов для биоinformatических анализов аннотирования структуры и функциональных характеристик белков, а также в исследовании "темного протеома" клеток.
Недавно результаты исследований совместных докторантов НАНА и Университета Монпелье, таких как Зарифе Османлы и ее коллеги (в том числе другой совместный докторант НАНА и Университета Монпелье, Тюркан Самедова, а также руководитель лаборатории интегративной биологии Института биофизики, член-корреспондент НАНА Ильхам Шахмуродов), были опубликованы в журнале “Biomolecules” с импакт-фактором 4.6.
Используя современные биоinformatические методы, авторы исследовали протеомы 57 эукариотных геномов и получили ряд интересных результатов. В частности, было установлено, что в изоформах белков по сравнению с каноническими белками меньше встречаются сигнальные пептиды, трансмембранные области и тандемные повторы, что может привести к изменению их функций или локализации в клетке. На основе полученных данных была предложена новая классификация структурных различий между каноническими белками и их изоформами, и выдвинута гипотеза, что, как и канонические белки, большинство их изоформ также подвержены воздействию естественного отбора с точки зрения их функций.
